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側根的發育與維甲酸(retinoids)

 

圖片來源:維基百科

維甲酸(retinoids)是一群結構與維生素A有關的化合物。在動物,維甲酸與細胞的分化、視力、免疫功能、抑癌基因的活化有關;但是動物無法合成維甲酸,必須由植物獲取。

許多植物都會合成維甲酸以及相關的化合物。但是植物合成維甲酸是要做什麼呢?最近的研究發現,維甲酸與植物的側根(lateral roots)形成有關。

植物在主根長出來以後,隔一段時間就會長出一條側根。已知側根在哪裡長出、何時長出,都受到調節,被稱為「側根鐘」(lateral root clock)。

為了要測試植物中是否也存在著與維甲酸結合的蛋白質,研究團隊使用了MCA(merocyanine aldehyde)。MCA的一端具有Cyanine-5 (Cy5)結構,另一頭則是類似於維甲酸的構造。當MCA與維甲酸結合蛋白結合時,Cy5這一邊就會放出螢光。

當研究團隊把阿拉伯芥(Arabidopsis thaliana)的根以10 μM的MCA處理後,在根部仍在發育的區域出現了一些螢光點;另外根尖生長點與還在分裂的細胞也出現了螢光。進一步的研究發現,這些螢光點不但與未來側根出現的地方重疊,且在側根生長點出現前五小時就可以看到螢光,顯示了維甲酸可能真的與側根的生長有關。

當研究團隊使用了抑制類胡蘿蔔素合成的化合物來處理植物根部時,由於維甲酸合成也經由同一途徑,於是螢光就大大地減少,側根的生長也受到了抑制,進一步顯示了維甲酸信號對側根合成的重要性。當研究團隊提供外來的維甲酸時,螢光再度出現,側根的生長頻率也回復了。

到底是植物的什麼蛋白質與維甲酸結合呢?研究團隊搜尋基因資料庫後發現,有個稱為TIL (AT5G58070)的基因,其序列與脊椎動物的lipocalin(維甲酸結合蛋白的一種)有相似性。進一步的分析發現,TIL出現的地方與側根出現的地方有重疊,表示TIL可能就是植物的維甲酸結合蛋白。在植物體外測試也顯示TIL的確可以與維甲酸結合。

缺少TIL的突變株,其側根的發育大大地減少,以MCA處理TIL突變株也看到螢光變得很弱,顯示了TIL的確就是透過與維甲酸結合來調節植物側根的生長。以維甲酸來處理缺少TIL的突變株,只有非常弱的反應,進一步確認了TIL在植物維甲酸信息傳遞上的角色。

所以,研究團隊發現了維甲酸對植物生長發育的角色,也找到了植物中會與維甲酸結合的蛋白質。未來可透過生物資訊的研究,找出其他植物的維甲酸結合蛋白,還可繼續研究維甲酸在植物生長發育上的角色。

參考文獻:

Alexandra J. Dickinson, Jingyuan Zhang, Michael Luciano, Guy Wachsman, Evan Sandoval, Martin Schnermann, José R. Dinneny, Philip N. Benfey. A plant lipocalin promotes retinal-mediated oscillatory lateral root initiation. Science, 2021; eabf7461 DOI: 10.1126/science.abf7461

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