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香蕉(Musa ssp.)是全球最大的單子葉植物(最高的是竹子),也是重要的水果與糧食作物。現在市面上的香蕉,幾乎都是Cavendish品系(華蕉),而過去則是Gros Michel(大米七)。
為什麼會從耐得住運輸的大米七換到華蕉,就不得不提到可怕的尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum f. sp. cubense(Foc))。這種真菌造成香蕉的黃葉病(又名巴拿馬病),在二十世紀初開始在中美洲的香蕉園肆虐。
由於大米七對於尖孢鐮刀菌完全沒有抵抗力但是華蕉有,所以在標準水果公司開始改種華蕉後,大家也紛紛改種了。
但是快樂的日子總是不會長久。到了1991年,尖孢鐮刀菌又捲土重來了。這麼一來,科學家們才發現,原來之前危害大米七的是熱帶第一型(Foc 1),而這次現身的是熱帶第四型(Foc 4)。熱帶第四型連華蕉都無法抵抗。
當然,培育可以抵抗熱帶四型的新品系是有必要的(而且台灣已經成功培育出兩個品系:台蕉5號與台蕉7號),但是深入瞭解究竟為何有些香蕉可以抗病、有些就不行,也非常重要。為什麼呢?因為瞭解了其中的機制,就可以在未來育種時更有效率。
最近發表在《自然遺傳》(Nature Genetics)上的論文,就是試圖解開這個謎題。
研究團隊仔細分析了大米七與華蕉的基因體。這兩個品系的香蕉,雖然都是由相同的三種香蕉Ban (Banksii),Dh (DH-Pahang),和Ze (Zebrina)組成的,但是基因體的大小卻有差別。華蕉的基因體明顯地較大。
研究團隊最關心的是,為什麼二十世紀初尖孢鐮刀菌出現的時候,大米七應風而倒?研究團隊發現,在大米七的Ze亞基因組中,少了RGA2基因的RLP區位,這是對Foc 1型抵抗所必需的。研究團隊認為,這個RLP區位可能來自於Zebrina基因組,它的缺失部分解釋了大米七對Foc 1型的易感性。
至於為何這些香蕉都無法抵抗熱帶四型,可能是因為不論是大米七或華蕉(還有許多香蕉品系),在Rga2基因上游有個轉座子插入,導致RGA2基因無法表現。由於RGA2基因的表現量與對熱帶四型的抗性強烈相關,所以這個發現對於瞭解為何熱帶四型如此恐怖有相當大的幫助。
另外,研究還發現了控制香蕉成熟過程的關鍵基因。香蕉的成熟過程涉及兩個正回饋循環,一個涉及乙烯的合成,另一個與乙烯的信號傳遞有關。研究團隊發現了一組稱為MaNAP(Musa acuminata NAC-like activated by apetala3/pistillata)的轉錄因子,是這兩個循環之間的連接節點。研究中發現了華蕉和大米七品種分別有五個和四個MaNAP同源基因。
其中特別是MaNAP4和MaNAP5這兩個新的同源基因,它們在果實中高度且專一性地表達,並與已知與果實成熟相關的基因(例如ACS和EXP)以及許多未知功能的基因結合。ACS是「1-氨基環丙烷-1-羧酸合成酶」,而EXP是「膨脹素」。ACS是乙烯生物合成途徑中的關鍵酶,EXP在調節植物細胞壁的伸展和軟化過程中起著重要作用。因此,MaNAP4和MaNAP5這兩個轉錄因子對香蕉成熟非常重要。
可惜台灣的台蕉5號與台蕉7號沒有一起分析,否則我們應該可以進一步瞭解為何它們不怕熱帶四型。
參考文獻:
Li, X., Yu, S., Cheng, Z. et al. Origin and evolution of the triploid cultivated banana genome. Nat Genet (2023). https://doi.org/10.1038/s41588-023-01589-3
另外,研究還發現了控制香蕉成熟過程的關鍵基因。香蕉的成熟過程涉及兩個正回饋循環,一個涉及乙烯的合成,另一個與乙烯的信號傳遞有關。研究團隊發現了一組稱為MaNAP(Musa acuminata NAC-like activated by apetala3/pistillata)的轉錄因子,是這兩個循環之間的連接節點。研究中發現了華蕉和大米七品種分別有五個和四個MaNAP同源基因。
其中特別是MaNAP4和MaNAP5這兩個新的同源基因,它們在果實中高度且專一性地表達,並與已知與果實成熟相關的基因(例如ACS和EXP)以及許多未知功能的基因結合。ACS是「1-氨基環丙烷-1-羧酸合成酶」,而EXP是「膨脹素」。ACS是乙烯生物合成途徑中的關鍵酶,EXP在調節植物細胞壁的伸展和軟化過程中起著重要作用。因此,MaNAP4和MaNAP5這兩個轉錄因子對香蕉成熟非常重要。
可惜台灣的台蕉5號與台蕉7號沒有一起分析,否則我們應該可以進一步瞭解為何它們不怕熱帶四型。
參考文獻:
Li, X., Yu, S., Cheng, Z. et al. Origin and evolution of the triploid cultivated banana genome. Nat Genet (2023). https://doi.org/10.1038/s41588-023-01589-3
谢谢你的介绍,写的很好。我觉得你可以翻译成英文做成科普介绍。 关于你最后说的两个香蕉品种不抗4号,虽然我们没有分析,但是fig2的a图展示了大部分不抗4号可能是因为rga2基因前面有转座子插入导致其不表达所以不抗。
回覆刪除感謝!不過那兩種香蕉是不怕4號,不是不抗4號喔。
刪除我剛剛把這一段資訊補進去了。非常感謝。
刪除有可能是rga2基因有功能,或者有别的抗病基因,值得深入研究这些基因从哪里来的 。
刪除我是文章作者liangsheng zhang,可以给翻译转载到facebook上吗?
回覆刪除我弄好了,請問要怎麼給你?
刪除你发给我邮箱zls83@zju.edu.cn,谢谢
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