Synechococcus. 圖片來源:維基百科 |
藍綠菌(cyanobacteria)是一群格蘭氏陰性的微生物,生活在池塘裡。它們因為有光合色素,所以可以進行光合作用。與高等植物不同的是,藍綠菌可以生活在比較不那麼舒適的環境下。
最近這些年,藍綠菌變得比較熱門,主要是因為可以利用它們來製造生質能源。透過許多人的努力,也已經建立了一些可以轉殖以及製作突變藍綠菌的方法。
最近有一個研究,筆者推測研究團隊應該是對乙醯轉移酶(acetyltransferase)有興趣,但是卻誤打誤撞踩進光合作用的領域裡。
怎麼說呢?因為研究團隊是先用相似性搜尋,把藍綠菌Synechococcus sp. PCC 7002裡面的離胺酸乙醯轉移酶(KAT,lysine acetyltransferase)都找出來,然後再測試這些基因,看它們所產製的蛋白質有沒有KAT活性。
其中有一個,一開始被稱為A1596,不論在細胞裡或在試管裡,都有KAT的活性。於是他們就感興趣了,接著看看這個基因(被改名為cGNAT2,Gcn5-related N-acetyltransferase)到底會乙醯化什麼蛋白質。
序列分析發現藍綠菌裡面有548個蛋白質都可能會被它乙醯化。這麼多當然不可能全中,但是其中有一個基因是NAD(P)H dehydrogenase J(NdhJ)。
進一步的測試發現cGNAT2在細胞裡面也會乙醯化NdhJ。NdhJ在藍綠菌裡面負責許多功能,包括光合作用的電子傳遞(從水到NADP+)與光呼吸作用,可能還參與了光保護作用(photoprotection)以及二氧化碳固定。研究團隊發現,當NdhJ被乙醯化(乙醯化的位置在第89個胺基酸「離胺酸」)以後,它的活性會下降。
那麼,如果沒有了cGNAT2,NdhJ就不能被乙醯化,會發生什麼事呢?
研究團隊就把cGNAT2這個基因給砍掉了,然後來看看這樣的藍綠菌會怎麼樣。
結果發現,少了cGNAT2的藍綠菌長得慢,而且本來這個藍綠菌在提供光源又給外部碳源(如甘油)的狀況下可以長得蠻快,但是缺少了cGNAT2的藍綠菌,即使又有光又有甘油,它還是長得很慢。
所以,總而言之,這個離胺酸乙醯轉移酶cGNAT2與光合作用有關,而過去在研究高等植物的光合作用時,並沒有發現乙醯化這種轉譯後調控(post-translational regulation)的現象。
所以,別小看藍綠菌,它也是很複雜的!
參考文獻:
Kun Jia, Mingkun Yang, Xin Liu, Qi Zhang, Gaoxiang Cao, Feng Ge, Jindong Zhao, Deciphering the structure, function, and mechanism of lysine acetyltransferase cGNAT2 in cyanobacteria, Plant Physiology, 2023;, kiad509, https://doi.org/10.1093/plphys/kiad509
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