跳到主要內容

表觀遺傳(epigenetic)讓抗性傳到下一代

 

DNA與組蛋白(histone)形成染色質。圖片來源:維基百科

表觀遺傳學(epigenetics)--指得是不透過改變DNA序列但仍能遺傳到下一代的現象--最近這幾年很熱門。其中一種機制是透過改變DNA纏繞組蛋白(histone)的方式,造成基因表達的改變。

我們的遺傳物質是由DNA構成,但這些長長的DNA在細胞中藉著組蛋白們的幫助,井然有序地纏繞起來。每146鹼基對的DNA纏繞著由八個組蛋白所構成的結構(這八個組蛋白為H2A, H2B, H3, H4),形成所謂的「核小體」(nucleosome),一個個的核小體之間又有組蛋白H1將它們連起來。當某一段DNA被甲基化或它所纏繞的組蛋白被甲基化時,會使得DNA的結構更加縮緊或鬆開。如果是縮緊(形成所謂的「異染色質」[heterochromatin]),那麼這一段基因就不能被轉錄(transcription),所以也不會被表現;如果是鬆開(形成所謂的「真染色質」[euchromatin]),那麼這一段基因就可以透過轉錄被表現出來。

這類的機制,過去比較有名的是DNA的甲基化(methylation),而最近發表在《自然》雜誌上的研究發現了細胞可以透過將組蛋白H3的第九個胺基酸(離胺酸)甲基化,使該區段的染色質成為異染色質,從而使細胞對咖啡因產生抗性。

來自愛丁堡大學的研究團隊,以裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)為實驗材料,將裂殖酵母以咖啡因處理後,裂殖酵母會因為組蛋白H3的第九個胺基酸甲基化(H3K9me)而對咖啡因產生抗性。

裂殖酵母除了對咖啡因產生抗性,H3K9me的變化也使它們的兩個酵素的表現改變:其中負責將H3K9me上的甲基移除的去甲基酶(demethylase)Epe1的表現會減少,而乙醯轉移酶(acetyltransferase)Mst2的表現會上升。Epe1表現減少使得H3K9me的改變可遺傳到下一代,使得這些對咖啡因有抗性的裂殖酵母,在細胞分裂後仍對咖啡因有抗性。

有趣的是,這些對咖啡因有抗性的裂殖酵母,對某些抗真菌的藥劑也有抗性:這讓研究團隊們想到,如果能應用到高等植物:也就是說,如果被咖啡因處理過的植物,也對咖啡因產生抗性、從而對某些抗真菌的藥劑產生抗性的話,未來可以應用這個現象,在噴灑抗真菌藥劑時,或可提高使用的劑量?當然這只是一個想法,能不能實際應用,還要先看用咖啡因處理過的高等植物是否也會產生與裂殖酵母類似的現象才行。

參考文獻:

Sito Torres-Garcia, Imtiyaz Yaseen, Manu Shukla, Pauline N. C. B. Audergon, Sharon A. White, Alison L. Pidoux, Robin C. Allshire. Epigenetic gene silencing by heterochromatin primes fungal resistance. Nature, 2020; DOI: 10.1038/s41586-020-2706-x

留言

這個網誌中的熱門文章

怎麼辦到的?變形藤(Boquila trifoliolata)模仿塑膠植物

  左:原來的葉片。右:模仿的葉片。圖片來源: 期刊 之前我們提到過一種奇妙的植物「變形藤」( Boquila trifoliolata ),它原產於南美洲智利中、南部與阿根廷。在2014年就被發現它 為了減少自己被吃 ,發展出奇妙的變形能力:爬到誰身上就長得像誰。 後來在2021年 發現 ,它不只是形狀學得像,連人家身上一大半的細菌都搬過來了。這就奇妙了。 為什麼「變形藤」能夠學得這麼像呢?是寄主植物釋放了揮發性化合物?還是寄主植物跟它進行了基因的交換?還是它真的能「看」? 研究團隊這次用了塑膠植物給它模仿。塑膠植物沒有基因、也不會釋放揮發性化合物,這樣就可以排除前兩個因素了。 結果「變形藤」還是學得維妙維肖,而且,一個月以後,它還學得更像。 難道它真的會「看」嗎?只能說這棵藤本植物真是太奇妙了。 參考文獻: White J, Yamashita F. Boquila trifoliolata mimics leaves of an artificial plastic host plant. Plant Signal Behav. 2022 Dec 31;17(1):1977530. doi: 10.1080/15592324.2021.1977530. Epub 2021 Sep 21. PMID: 34545774; PMCID: PMC8903786.

植物界的變色龍Boquila trifoliolata如何模仿?

  圖片來源: 維基百科 信不信植物界也有變色龍?原產於南美洲智利中、南部與阿根廷的藤本植物 Boquila trifoliolata 在攀爬到其他樹上時,葉片的形狀會從原本的長鈍橢圓形三出複葉改變為宿主植物的形狀;甚至當它從一種植物攀爬到另一種植物時,葉片的型態也會跟著改變。 過去的研究發現, Boquila trifoliolata 之所以做這樣的改變,可能是因為 可以讓它避免被吃 。但是到底「變色龍藤」是怎麼「看」到它攀爬上去的植物長什麼樣子呢? 最近發表在Scientific Report上的研究發現,「變色龍藤」可能是從「宿主」的菌群(microbiota)得到資料。研究團隊收集了「變色龍藤」模仿「宿主」的葉片上的菌群(BR)、沒有模仿「宿主」的葉片上的菌群(BT),以及「宿主」的菌群(RS)。結果發現,沒有模仿「宿主」的葉片上的菌群(BT)與「宿主」的菌群(RS)之間只有共享了79個獨特的OTU(操作分類單元,可能代表細菌的屬或種),但模仿「宿主」的葉片上的菌群(BR)與「宿主」的菌群(RS)之間卻共享了255個獨特的OTU!更有趣的是,沒有模仿「宿主」的葉片上的菌群(BT)與模仿「宿主」的葉片上的菌群(BR)間也只共享了33個OTU。 這個結果顯示了,「變色龍藤」能模仿「宿主」的型態,與它們之間共享的菌群高度相關。但是究竟「變色龍藤」是如何從這些菌群得到資料?這就有待進一步的研究了。 參考文獻: Gianoli, E., González-Teuber, M., Vilo, C. et al. Endophytic bacterial communities are associated with leaf mimicry in the vine Boquila trifoliolata. Sci Rep 11, 22673 (2021). https://doi.org/10.1038/s41598-021-02229-8

關於蕃薯,你知道你吃的是什麼品種嗎?

蕃薯( Ipomoea batatas )從臺灣人的主食、轉變為副食、又轉變為飼料,最後在養生的風潮下,再度躍上餐桌,成為美食,可有人關心過,我們吃的蕃薯是什麼品種嗎? 圖片來源: 農委會 上面這張照片裡的蕃薯,中間的TN57與TN66,就是台農57號與台農66號,是臺灣最受歡迎的兩種蕃薯喔! 台農57號在1955年由嘉義農試分所將日治時代培育出的台農27號與南瑞苕種(Nancy hall)雜交育成。它黃皮黃肉,目前還是全臺灣產量最大的蕃薯。口感鬆軟,適合烤、煮食或製作薯條。主要產地在雲林、台南、高雄。適合在四~十月間種植。台農57號還曾經隨著農技團飄洋過海到史瓦濟蘭去,協助他們解決糧食問題呢! 至於台農66號呢,就是所謂的紅心蕃薯啦!台農66號是1975年也是由嘉義農試分所選出,1982年正式命名。它是目前栽植最普遍的食用紅肉番薯。在臺灣,幾乎全年皆可栽種,秋冬作五個月可收穫,春夏作四個月就可以收穫囉! 最右邊的台農73號,就是現在所謂的「芋仔蕃薯」啦!它是在1990年以台農62號(♂)x清水紫心(♀)雜交後,在2002年選拔出優良子代CYY90-C17,並於2007年正式命名。由於肉色為深紫色,所以得到「芋仔蕃薯」的暱稱。本品種富含cyanidin 及peonidin 等花青素,具抗氧化功用。 至於常吃的蕃薯葉,則是以桃園2號與台農71號為主,這兩種葉菜蕃薯都不用撕皮就可以直接煮來吃,而且莖葉不易倒伏,方便農民採收喔! 如果您愛吃的是蕃薯的加工食品,如蕃薯餅、蜜蕃薯、蕃薯酥,其實他們大多也是用台農57號與66號來加工的喔! 參考文獻: 蔡承豪、楊韻平。2004。臺灣蕃薯文化誌。貓頭鷹出版。 行政院農委會。 甘藷主題館 。