細菌的RNase P。黃色部分是RNA。圖片來源:維基百科 |
要提升作物產量,除了增加作物的產出,減少農損也是必要的。在眾多造成農損的因素裡,病毒感染也是其中之一。根據資料,病毒感染在美國一年造成數百億美金的損失;如果能找到一種機制,可以無差別地針對病毒進行攻擊,應該對於提升作物的產量有很大的幫助。
感染植物的病毒有超過八成為RNA病毒。這些RNA病毒在其基因體的尾端(3'端)有一個類似轉移RNA的結構(tRNA-like structure,TLS)。這個TLS對於病毒的感染能力以及複製能力都很重要。如果能把這個結構給切掉,就能抑制病毒的複製與感染能力了。
自然界有沒有能切這個結構的酵素呢?有的,就是植物的核糖核酸酶P(RNase P)。植物的RNase P原來是在轉移RNA成熟時所必須的酵素,它負責把前轉移RNA(pre-tRNA)的頭端的領導序列(5' leader sequence)給切除。雖然大多數的RNase P還要跟一個RNA結合(如上圖),但有一種RNase P是不含RNA的。這種只由蛋白質構成的RNase P被稱為PRORP。PRORP負責將一些粒線體信息RNA(mRNA)在頭端或尾端的TLS給切掉,讓信息RNA成熟。
於是研究團隊就想到,如果能讓這種PRORP出現在細胞質裡面(目前它們只出現在粒線體),它們是不是就可以去切除RNA病毒的TLS,讓這些RNA病毒無法複製?於是研究團隊就編輯了阿拉伯芥(Arabidopsis thaliana)的PRORP,讓這個蛋白質出現在細胞質裡面。
阿拉伯芥總共有三個PRORP,研究團隊挑選其中的一個,PRORP2,將它的核定位信號(NLS,nuclear localization signal)剔除。剔除後的PRORP2可表現於細胞質中,且可以切除蘿蔔黃色花葉病毒(TYMV,turnip yellow mosaic virus)的TLS。
過去PRORP都是表現在細胞核、葉綠體與粒線體,改變它的位置,是否會造成不良反應呢?研究團隊將這個編輯過的PRORP2放入植物後,並沒有對植物產生什麼有害的作用。以病毒去感染這些植物發現,病毒RNA的量有減少,但症狀似乎沒有太大差別。
雖然結果好像不是那麼盡如人意,但是阿拉伯芥還有另一個PRORP可以試試看。或許將來還能夠找到更好的方法來抑制病毒感染。
參考文獻:
Gobert, A., Quan, Y., Arrivé, M. et al. Towards plant resistance to viruses using protein-only RNase P. Nat Commun 12, 1007 (2021). https://doi.org/10.1038/s41467-021-21338-6
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