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比較不同棉花（cotton）的基因體

棉花是主要的植物纖維作物，但它的價值不只是供應纖維而已。棉花的纖維可以做衣料、種子可以搾油、油粕可以做飼料。在美國，95%種植「美國棉」（高地棉，Upland cotton，Gossypium hirsutum），5%種植海島棉（在美國被稱為American Pima，G. barbadense）。

為了更瞭解棉花，由美國幾個研究團隊共同努力定序了高地棉、海島棉，還有夏威夷棉（G. tomentosum）、達爾文棉（G. darwinii）以及G. mustelinum等三種野生棉花，並比較它們的基因體。

夏威夷棉。圖片來源：維基百科
達爾文棉。圖片來源：維基百科

比較的結果讓研究團隊有些驚訝。研究團隊原本希望可以找到更多抗病抗蟲基因，但卻沒有什麼新發現。

雖然與棉花的性狀相關的基因上，研究團隊找到了一些不同的基因，但是許多地方還是相當相似、甚至有完全相同的部分，讓研究團隊以為是否不小心污染了樣本，所以把相同的基因體給定序了五次。妙的是，在田地裡可以很容易辨別出這些棉花的不同之處。

參考文獻：

Z. Jeffrey Chen, Avinash Sreedasyam, Atsumi Ando, Qingxin Song, Luis M. De Santiago, Amanda M. Hulse-Kemp, Mingquan Ding, Wenxue Ye, Ryan C. Kirkbride, Jerry Jenkins, Christopher Plott, John Lovell, Yu-Ming Lin, Robert Vaughn, Bo Liu, Sheron Simpson, Brian E. Scheffler, Li Wen, Christopher A. Saski, Corrinne E. Grover, Guanjing Hu, Justin L. Conover, Joseph W. Carlson, Shengqiang Shu, Lori B. Boston, Melissa Williams, Daniel G. Peterson, Keith McGee, Don C. Jones, Jonathan F. Wendel, David M. Stelly, Jane Grimwood, Jeremy Schmutz. Genomic diversifications of five Gossypium allopolyploid species and their impact on cotton improvement. Nature Genetics, 2020; DOI: 10.1038/s41588-020-0614-5
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